清同治八年(1869年),圣三一基督教堂始建。
清光緒十九年(1893年),圣三一堂的左側(cè)又增建了一座高聳的鐘樓。鐘樓為四方形平面,尖椎形屋頂,四角有4個(gè)小尖頂。鐘樓內(nèi)安置了八音大鐘,能按著圣詩的音韻敲打。
1966年8月,鐘樓毀于文化大革命破四舊中。
圣三一基督教堂是上?,F(xiàn)存較早的基督教堂,因其紅磚砌筑的外墻而被稱為“紅禮拜堂”。在20世紀(jì)30年代以前,其鐘樓曾經(jīng)長期是上海的制高點(diǎn)和較醒目的地標(biāo),是上海當(dāng)時(shí)較美的建筑之一。
2017年,圣三一基督教堂的修繕工程獲得聯(lián)合國教科文組織亞太文化遺產(chǎn)保護(hù)杰出項(xiàng)目獎(jiǎng)。
2019年10月7日,圣三一基督教堂被中華人民共和國國務(wù)院公布為第八批全國重點(diǎn)文物保護(hù)單位名單。