對通過國家級高企認定的企業(yè)，市級財政給予一次性獎勵10萬元，各區(qū)級財政還將給予10萬元-25萬元不等的一次性獎勵。首次備案為市級高企市財政給予一次性獎勵5萬元，區(qū)級財政還給予一次性獎勵10萬元。2017年僅市級財政就兌現(xiàn)兩級高企一次性補貼超1.1億元。此外，企業(yè)還可申請研發(fā)經費補助，每年每家企業(yè)補助額度最高可達到250萬元。

高新技術企業(yè)是指：在《國家重點支持的高新技術領域》內，持續(xù)進行研究開發(fā)與技術成果轉化，形成企業(yè)核心自主知識產權，并以此為基礎開展經營活動，在中國境內(不包括港、澳、臺地區(qū))注冊的居民企業(yè)。
廈門高新技術企業(yè)認定條件
（一）企業(yè)需具有獨立法人資格、獨立經營場所，申請備案時在廈門市注冊成立滿一年以上；
（二）企業(yè)通過自主研發(fā)、受讓、受贈、并購等方式，獲得對其主要產品（服務）在技術上發(fā)揮核心支持作用的知識產權的所有權，企業(yè)申報前擁有I類自主知識產權1項（含）以上或申報前三年內擁有II類自主知識產權2項（含）以上；
（三）對企業(yè)主要產品（服務）發(fā)揮核心支持作用的技術屬于《國家重點支持的高新技術領域》規(guī)定的范圍；
（四）企業(yè)從事研發(fā)和相關技術創(chuàng)新活動的科技人員占企業(yè)當年職工總數(shù)的比例不低于10%，近一年繳交社會保險或個人所得稅超過6個月（含）的職工不少于5人；
（五） 近一年銷售收入一般不低于50萬元且不高于2億元，若低于50萬元的，其近一年研究開發(fā)費用總額不低于50萬元；
（六）近一年的研究開發(fā)費用總額占同期銷售收入總額的比例不低于3%；
（七）近一年高新技術產品（服務）收入占企業(yè)同期總收入的比例不低于50%；
（八）企業(yè)申請備案前一年內未發(fā)生重大安全、重大質量事故或嚴重環(huán)境違法行為。
提交材料
1.市級高新技術企業(yè)備案申請書；
2.知識產權相關材料；
3.企業(yè)職工和科技人員情況說明材料；
4.經具有資質的中介機構出具的企業(yè)近一個會計年度研究開發(fā)費用和高新技術產品（服務）收入專審報告或鑒證報告；
5.經具有資質的中介機構鑒證的企業(yè)近一個會計年度的財務會計報告；
6.近一個會計年度企業(yè)所得稅年度納稅申報表。