膠原蛋白肽比較常見的提取方法是酸法提取、堿法提取、鹽法提取、酶法提取。

1、酸法提取主要采用低離子濃度酸性條件浸漬處理原料，從而破壞分子間的鹽鍵和希夫堿，而引起纖維膨脹、溶解。主要使用的溶劑有鹽酸或亞硫酸、磷酸、硫酸、醋酸、檸檬酸和甲酸等，其缺點(diǎn)：環(huán)境污染、反應(yīng)后容易產(chǎn)生灰份、鹽份。

2、堿法提取膠原蛋白常用的處理劑為石灰、氫氧化鈉、碳酸鈉等。由于堿法提取容易造成肽鍵水解，因此得到的水解產(chǎn)物分子量比較低。缺點(diǎn)：環(huán)境污染、反應(yīng)劇烈，容易破壞產(chǎn)品營養(yǎng)成分。

3、鹽法提取膠原蛋白所用的中性鹽酸、氯化鈉、檸檬酸鹽等。在中性條件下，當(dāng)鹽的濃度達(dá)到一定量時(shí)，膠原溶解。并且可采用不同嘗試的氯化鈉對提取的膠原蛋白進(jìn)行鹽析處理，可以沉淀出不同類型的膠原蛋白。缺點(diǎn)：鹽分高。

4、酶法提取是利用蛋白酶使膠原蛋白溶解，水解條件溫和，反應(yīng)速度快，提取的膠原蛋白仍有完整的三股螺旋結(jié)構(gòu)，蛋白純度高，理化性質(zhì)穩(wěn)定，且無環(huán)境污染。